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生于1953年8月，江苏镇江人，无党派，研究生学历，科学博士。1970年参加工作。

1970年4月至1975年10月为江西省信丰县、横峰县插队知青，1978年9月至1981年9月在上海第二医学院医疗系血液病学专业攻读硕士学位，1981年9月至1984年9月任上海第二医学院附属瑞金医院血液病研究室内科住院医师，1984年9月至1989年7月任法国巴黎第七大学圣·路易医院血液中心实验室外籍住院医师并攻读博士学位，后做博士后研究。1989年7月后历任上海第二医科大学附属瑞金医院内科主治医师，上海血液学研究所分子生物学中心实验室主任、研究员，上海血液学研究所副所长、所长，国家人类基因组南方研究中心主任。2000年10月至2007年6月 任中国科学院副院长。2007年6月29日，在十届全国人大常委会第二十八次会议上被任命为卫生部部长 。2008年3月在十一届全国人大一次会议上被任命为卫生部部长。

陈竺于1995年当选为中国科学院院士，是十届全国政协委员。

陈竺在血液学、分子生物学等领域有较高造诣，取得了突破性成果，曾获得法国抗癌联盟卢瓦兹奖、国家科技进步二等奖等多个奖项。陈竺是第三世界科学院院士、欧洲科学院外籍院士、美国科学院外籍院士、法国科学院院士。2007年10月8日被选为美国医学科学院外籍院士。